🧬 클로닝 초보자를 위한 SnapGene 완벽 가이드: 첫 단추부터 제대로!

마치 포토샵이 이미지 편집에 필수인 것처럼,

Snapgene은 Cloning에서 없어서는 안 될 소프트웨어입니다.

특히, Cloning 실험을 할 때 Snapgene을 활용하면 복잡한 DNA 서열을 직접적으로 확인하고,

실험 과정을 미리 시뮬레이션하여 오류를 줄일 수 있는데요~ 

 

Snapgene사용법에 대해 하나씩 같이 해보도록 해요!

 

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1. 프로그램 설치하기

① 'Google'에 'SnapGene Viewer'을 검색합니다

  : Cloning 작업은 'SnapGene Viewer'만으로 충분해요ꔛ

 

 

 

② 하단의 순서대로 프로그램을 설치해줍니다!

 

③ 다음은 'target gene' 에 대한 정보를 찾을 차례입니다!ꔛ

 예시로, 'ANXA1'이라는 유전자에 대한 정보를 찾아보려고 하는데요

 'NCBI Nucleotide' - ①'target gene' 입력 후 'Search' - ② 'Organism'선택 - ③ target gene mRNA 선택 순서로 진행해볼께요

☝Tips 

  👩🏻‍🎓target gene mRNA 선택 시 주의 사항! partial인 경우도 있으니 full sequence를 원하시는 분은 주의해서 선택하도록 하세요ꔛ

 

📌 NCBI Nucleotide의 Top Organism 정리

(학명이 익숙하지 않은 분들을 위해 표로 정리해보았어요!)

 

 

 

 

④ 하단에 스크롤을 내려서 ① 'CDS'를 누르면 하단의 ② Sequence (갈색표기)가 나오는데, 이 부분을 드래그해서 복사 (Ctrl+C) 해주세요

 

 

⑤ 다음은 'Snapgene' 을 열어서 복사한 sequence를 붙여주는 단계인데요!

 : ① 'New DNA File' 클릭 - ② ' Create the following sequence' 에 복사한 sequence를 붙여줍니다! - ③ 'File Name' 표기

 

☝Tips 

  👩🏻‍🎓'File Name'의 경우 종+target gene을 같이 표기하면 나중에 헷갈리지 않아요!

  저는 hANXA1 or human ANXA1과 같이 표기해두고 있어요✨

  👩🏻‍🎓Sequence를 넣으면 feature 이 같이 표시되는데, 체크하고 생성하면 됩니다

⑥ Target gene map 생성 완료!

☝Tips 

👩🏻‍🎓이 부분까지 설정했다면, cloning을 위한 insert map, primer 제작, shRNA/siRNA제작 모두 가능해요!

 

 

https://snapgene-viewer.software.informer.com/4.1/ https://snapgene-viewer.software.informer.com/4.1/

SnapGene Viewer. Get the software safely and easily.

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nucleotide/

Home - Nucleotide - NCBI

 

 

관련해서 궁금하신 부분이 있다면 댓글 부탁드려요 ꔛ ෆ˙ᵕ˙ෆ